Resumo. A soja (Glycine max (L.) Merr.) é uma das culturas de maior importância econômica no mundo, e o Brasil é o maior produtor mundial desse grão. A produtividade da cultura é definida principalmente pela interação da planta com ambiente e manejo, principalmente o manejo fitossanitário e o nutricional. Assim, objetivou-se avaliar os custos de produção e seus efeitos na produtividade sobre os métodos de consórcio de produtos químicos ou biológicos para o manejo de fitopatógenos, em função de doses de Boro aplicado na dessecação e/ou aplicado posterior suplementação em R1 (início da floração). O experimento foi instalado sob sistema de plantio direto, na Fazenda Rio Verdinho Três Barras, Rio Verde, Goiás, Brasil, no período de Outubro 2021 a Março de 2022, com espaçamento de 0,45 m utilizando a cultivar de soja DM 68i69 IPRO, recomendada para a região. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados, com 11 tratamentos e quatro repetições. Os tratamentos consistiram em 2 manejos fitossanitários (tratamento de sementes com produtos biológicos e tratamento padrão da maioria dos produtores do Sudoeste Goiano) para o controle de fitopatógenos e 5 doses de Boro (0; 0,25; 0,50;0,75 e 1,0 L ha-1) aplicada na dessecação e/ou aplicado posterior suplementação em R1. Ao final, foram avaliados a produtividade final e os custos de produção. Os dados foram submetidos à análise de variância pelo teste de F com p < 0,05 e as médias foram comparadas pelo teste Duncan com p < 0,05. Para estimar o custo de produção, foi utilizado a estrutura de custo operacional total de produção, proposto pelo Instituto de Economia Agrícola – IEA. Maiores aplicações de Boro na dessecação nas doses 1 L ha-1 ou 0,75 L ha-1 e menores doses de Boro no estágio R1 aumenta significativamente a produtividade dos grãos de soja. Os tratamentos testados não influenciaram o custo operacional total (COT), o custo operacional total relativo (COEr), a receita bruta (RB), o lucro operacional efetivo (LOE), o lucro operacional total (LOT), a lucratividade, bem como a estimativa de produção e estimativa de equilíbrio. A estimativa do COT da soja cultivada em Rio Verde, Goiás, Brasil, foi de R$ 10.616,52 ha-1 com produtividades de até 95 sacas ha-1.