Resumo. A produção científica de três centros de pesquisa da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) foi aferida objetivando verificar a relação entre produtividade científica, considerada variável dependente, e algumas variáveis independentes de natureza estrutural e não-estrutural. Um questionário foi enviado a 763 pesquisadores, representando 100% do universo de pesquisadores dos: Centro de Pesquisa Agropecuária dos Cerrados (CPAC), Centro de Pesquisa Agropecuária do Trópico Semi-Árido (CPATSA), e do Centro de Pesquisa Agropecuária do Trópico Úmido (CPATU), havendo um retorno de 117 respostas (71,7%). A análise dos dados permitiu concluir que as variáveis independentes: a faixa etária, a qualificação acadêmica, o tempo de titularidade, o tempo efetivo na pesquisa, o grau de domínio (total ou  parcial) do idioma inglês, o número de assinaturas pessoais de periódicos científicos e a participação em associações científicas no Brasil foram fatores condicionantes ao processo da produção científica. O estilo de administração e a autonomia, considerados como variáveis independentes de natureza estrutural, interferiram na produtividade dos pesquisadores, porém em magnitudes reduzidas. Conditional variables of the scientific production process of the agricultural research centers of embrapa Abstract The scientific production at the agricultural research centers of Embrapa was described in order to verify the relationship between scientific productivity and some independent variables. A questionary was sent to 163 researchers (100%) in three agricultural research centers of Embrapa with 71,7% of return rate (117 individual responding): from the Cerrados Agricultural and Cattle Raising Research Center (CPAC), located in Planaltina, Federal District (Center-West Region) replied 35 researchers; from the Semiarid Tropical Agricultural and Cattle Raising Research Center (CPATSA), located in Petrolina, PE (Northeast Region) replied 31 researchers and from the Humid Tropical Agricultural and Cattle Raising Research Center (CPATU), located in Belém, PA (North Region) replied 51 researchers. Data from the scientific production, a dependent variable, was crossed with the independent variables: the increase of age, academic qualification, time of qualification, time spent on research, the understanding (total or partial) of the English language, personal journals subscriptions and affiliation with scientific associations in Brazil were determinant factors on the process of scientific production. On the other hand, it was found that administrative style did not play a significant role on the process of the scientific productivity.